相关挂牌公司研发支出的大幅增长，促使新三板中“新经济”板块的崛起。
2016年度，在新三板公司整体业绩持平的背景下，以生物科技、国防航空、新能源设备、物联网技术等为代表的“战略新兴产业类”公司却表现亮眼。有数据统计显示，在新三板挂牌的“战略新兴产业类”公司共2752家，剔除部分数据缺失的公司，有1081家公司整体营收同比增长36.79%，整体净利润同比增长22.81%。值得关注的是，这1081家公司2016年度平均研发支出达1010.2万元，较上年的平均784.95万元，增幅高达28.7%。其中，820家公司2016年度研发支出同比呈现正增长，占比逾七成。
以新三板公司新产业为例，其2016年度财报显示，公司全年研发投入达4717万元，占营业收入的5.11%，较上一年的研发投入2805万元和占比3.83%，均出现较大幅度的提升。新产业主要从事“全自动化学发光免疫分析仪器及配套试剂”的研发、生产和销售，公司通过相关仪器及试剂项目的研发，巩固和提高了在国内免疫诊断领域的竞争力。尤其是公司模块化生化免疫分析系统Biolumi8000各模块取得注册证，并完成研发转生产，丰富了公司产品线，为公司未来几年业务的持续快速增长奠定了基础。2016年，新产业实现营业收入9.23亿元，同比增长26.08%；实现净利润4.52亿元，同比增长81.32%。
而主营树脂复合新材料生产制造的圣泉集团更是在年报中直言“创新是圣泉集团发展的核心和灵魂”。公司财报显示，2016年度，公司研发投入高达1.74亿元，占营业收入的比重为4.95%，比上年增长14.5%。正是通过加大研发创新投入，公司在2016年开拓了石墨烯新材料在医疗用品、智能服装、超级电容等领域的应用。
事实上，细看新三板“战略新兴产业类”公司研发支出统计表可以发现，排名靠前的大多是受到资本热捧的明星企业。如主营证券投资软件研发销售的益盟股份，其挂牌新三板以来共募资12.5亿元，吸引了包括腾讯、朴易投资、光大资本、朱雀投资、银领资管等在内的数十家机构参与认购。又如从事高端钛合金材料和低温超导材料研发的西部超导，挂牌以来先后向华安资管、中信建投基金、宝盈基金、朱雀投资等机构投资者及做市商募资10.75亿元。而芯能科技、英雄互娱、圣泉集团、成大生物、大汉三通、麒麟文化、原子高科、亿玛在线、优炫软件等明星公司均跻身研发前50强榜单。
可以预期的是，随着国家对中小企业研发创新的扶持力度不断加大，新三板“战略新兴产业类”公司研发支出将进一步增加。5月2日，国家财政部、税务总局、科技部联合发布了《关于提高科技型中小企业研究开发费用税前加计扣除比例的通知》，科技型中小企业开展研发活动中实际发生的研发费用，未形成无形资产计入当期损益的，在按规定据实扣除的基础上，在2017年1月1日至2019年12月31日期间，再按照实际发生额的75%在税前加计扣除；形成无形资产的，在上述期间按照无形资产成本的175%在税前摊销。
北京中证天通会计师事务所的一位会计师告诉记者：“以前都是加计50%，现在扣税力度增加，对于规模较大的新三板企业来说，确实蛮乐观的。而且，在当下税务审查趋严的情况下，该政策有利于真正的创新企业脱颖而出。”