公司治理及内部控制有所改善，规范度不断提升。挂牌公司在挂牌前往往具有股权集中度高、内部控制强、经营管理相对不透明的特点，但进入新三板后，对其规范要求和引导作用明显加强。制度建设方面，有7424家公司在2016年度建立新的公司治理制度，占比70.64%，同比提升9.22个百分点；有5776家公司建立年度报告重大差错责任追究制度，占比54.96%，同比提升26.23个百分点。外部制衡方面，有725家公司开始设独立董事，665家公司管理层引入了职业经理人。资金管理方面，存在资金占用现象的公司占比较上年大幅下降23.57个百分点，目前约为18.23%。
企业获得的支持力度加强，经营环境改善。规范性的提高，一定程度上消除了政府和市场支持中小微企业的顾虑。年报显示，依托新三板，2016年共有5771家公司通过专项金融产品等方式获得银行贷款4871.27亿元，9459家公司获得政府补贴206.86亿元。统计发现，获得支持较大的企业往往也能实现较好的发展，如挂牌以来获得过大额融资的492家公司(剔除金融业和神州优车)，2016年实现营业收入2987.06亿元，净利润215.80亿元，分别同比增长31.34%和22.55%。
挂牌公司在获得社会支持取得发展的同时，积极承担社会责任，成熟型企业回报股东力度较强。8084家挂牌公司披露了扶贫与社会责任事项，其中2151家挂牌公司响应扶贫号召，积极投入扶贫工作。扩大就业方面，挂牌公司员工人数达276.19万人，同比增长14.99%，较全国城镇就业人员增长率高11.74个百分点。权益分配方面，共2350家挂牌公司公布预案，占已披露年报挂牌公司家数的22.27%。其中1734家实施现金分红，拟发放现金股利合计239.82亿元，占其2016年度净利润的47.40%。