审计报告指出，中央预算执行情况总体较好，中央财政一般公共预算收入完成预算的100.02%，保障了发展需要。2016年中央决算草案与向全国人大报告的预算执行情况的差异明显缩小，反映出中央预决算编制水平进一步提高，预算执行的规范化程度也进一步提升。
胡泽君指出，对中央财政管理及决算草案审计，中央部门预算执行审计，国家重大政策措施落实跟踪审计等各项审计中，发现并移送重大违纪违法问题线索600多起，涉及公职人员1100多人。具体而言，国有资产资源和公共权力集中领域问题较多，有70%发生在财政资金分配，投资并购，信贷发放，上市融资等审批决策和管理中，多与以权谋私，违规操作有关。
此外，民生领域小官贪腐问题较为突出。在扶贫，社保，生态环保等审计中发现此类问题300多起，涉及基层经办人员450多人，一般单起金额小，发生频率高，有关人员在立项申报，资金支拨等出入口容假掺假，冒名截留，验收检查搞走过场。
在国家重大政策措施落实跟踪审计情况中还发现，有的政府投资基金未达到预期效果。抽查的16个省至2016年底设立政府投资基金235只，实际到位资金中引入社会资本仅占15%。有的基金运作市场化程度不高，其中122只基金的管理公司由政府部门直接指定，103只基金的管理公司有342名高管或投委会成员由政府部门直接指定或委派。
部分地方政府债务增长较快，有的还违规举债。至2017年3月底，审计的16个省，16个市和14个县本级政府债务风险总体可控，但政府承诺以财政资金偿还的债务余额，较2013年6月底增长87%，其中基层区县和西部地区增长超过1倍。7个省，6个市和5个县本级2015年以来，通过银行贷款，信托融资等形式，违规举借的政府承诺以财政资金偿还债务余额有537.19亿元。
人大财经委报告建议，要把防控地方债务风险摆在更加重要的位置，牢牢守住不发生系统性风险的底线。对一些地方政府及所属机关事业单位通过不规范的政府和社会资本合作(PPP)，政府投资基金，政府购买服务等形式违法违规融资的行为，要继续加强监管，依法问责并公开曝光。地方各级人大及其常委会不得违法为政府举债融资作出承诺或者担保等决议等。