据统计，截至2017年4月28日，新三板共计11113家公司需要披露2016年年度报告，其中，10554家已完成披露工作，559家公司未能按期披露年度报告，其中包括创新层和基础层企业。根据相关规定全国股转系统决定自2017年5月2日起暂停未按期披露年报公司的股票转让。
根据分层管理办法，每年5月份最后一个交易周的首个转让日调整挂牌公司所属层级（进入创新层不满6个月的挂牌公司不进行层级调整）。基础层的挂牌公司，符合创新层条件的，调整进入创新层；不符合创新层维持条件的则调整进入基础层。另外，创新层企业需按时编制并披露年度报告。这意味着除了被强制暂停转让之外，上述559家企业也将无缘进入创新层。
《证券日报》采访的多位券商人士认为，自2016年新三板实施分层以后，监管层不断加强监管，相关制度供给尤其是针对创新层的制度供给仍未陆续出台，在今年强化监管的基础上，预计今年第四季度或将有创新层制度供给出台，因此今年5月份的首次调层尤其吸引企业注意。
东北证券新三板研究中心总监付立春认为，今年将是新三板出台政策红利的“大年”，预计大宗交易将推出，甚至有可能推出集合竞价等红利政策，监管层也可能会在创新层基础之上再设立精选层。
据联讯证券新三板研究院根据年报筛选统计，除上述559家企业以外，目前已有957家尚在基础层的企业符合新进创新层的分层标准。另外，在现有创新层企业中，按照分层管理办法，一旦业绩、合格投资者人数、流动性方面不合格，依然会被剔除创新层，目前已有530家企业符合继续维持在创新层的分层标准。